Utworzono je w 1950 roku po przeprowadzeniu niezbędnych prac remontowych. Zamek posiada bogate i szczególnie interesujące zbiory muzealne reprezentujące kulturę materialną Dolnego Powiśla (obejmującego: ziemię kwidzyńską, suską i sztumską).
Ekspozycja historyczna
Eksponaty muzealne są podzielone na kilka działów: historyczny, broni i przyrodniczy, etnograficzny, rzemiosła artystycznego. Niezwykle interesujące są zbiory historyczne, które zawierają m.in. ekspozycję średniowiecznych narzędzi tortur budzących zainteresowanie i strach wśród dzieci dzięki temu, że posiadają ciekawe nazwy, np. skrzypce hiszpańskie, płaszcz hiszpański, kuna oraz pień i topór katowski. Ciekawostką jest „szafa Juranda” czyli szafa tortur, która była rekwizytem w filmie „Krzyżacy”. Najstarszym z zabytków w zbiorze broni jest bombarda krzyżacka z początku XV wieku.
Zamek w Kwidzynie jest na trasie samochodowego Szlaku Zamków Gotyckich, prowadzącego przez 12 miejscowości Warmii, Mazur, Powiśla i Kaszub.
Ekspozycja przyrodnicza
Ekspozycja przyrodnicza zajmuje w Muzeum dużo miejsca i zawiera rzadkie okazy ptaków np. głuszca, dropa, ślepowrona. Znajdują się tu zwierzęta z terenów Polski północnej a także egzotyczne tj. bizon, czy jak tybetański. Jest też wystawa szkieletów (można podziwiać ząb mamuta) atrakcja wzbudzająca podziw u dzieci. W zbiorze etnograficznym możemy znaleźć ciekawą kolekcję mebli polichromowanych, zbiory ceramiczne, kolekcję skrzyń, szaf itp. Dział rzemiosła artystycznego prezentuje meble wykonane w warsztatach elbląskich, rzeźby sakralne z XV-XVIII wieku.
