Jezioro jest użytkowane rybacko. Jezioro Głęboczko jest dużym i głębokim jeziorem lobeliowym o głębokości 28 m. W jeziorze tym występują liczne populacje gatunków charakterystycznych dla jezior lobeliowych: stroiczki wodnej, poryblinu jeziornego i brzeżycy jednokwiatowej.

W toni wodnej znajduje się także grążel żółty, a na brzegach wykształcają się szuwary: trzcinowy, turzycy dzióbkowatej, turzycy nitkowatej i skrzypu bagiennego. Jezioro leży w malowniczym krajobrazie wysoczyzn morenowych. Rezerwat powstał w 2009 r. i nie jest udostępniony do zwiedzania.